首先，电子签证不对个人开放，而是挑选部分经验丰富、在移民局有良好记录的中介机构作为代办点；其次，在申请人获得签证后，所有申请材料必须由代办中介保留一年，如果被抽查的学生有问题，学生将被取消签证，该中介机构也会受到相关处罚，甚至被取消电子签证资格；最后，在电子签证审理过程中，移民局会采用“定向调查”和“随机抽查”的方法，来确保这些中介递交的学生申请真实可靠。
电子签证与传统签证的最大区别之一就是审批速度快，但就目前审理情况而言，有些申请也需要1-2个月甚至更长时间才能获批。其实移民局明确要求电子签证的递交时间是在不迟于开课时间3个月，不早于4个月。但由于有很短时间内就得到签证的先例，不少中介和学生都愿意冒险在距离开课时间很近的时候开始申请，如果并没有像想像的那样很快通过审批，就会出现入学时间安排很紧张的局面，甚至导致延误入学。
此外，电子签证并不是所有人都能够使用，有一些学生签证的申请人是不能使用网上电子签证方式的。比如正在其他国家常驻留学的中国学生、18岁以下学生的监护人、父母探亲等，他们都必须通过传统的书面形式递交签证申请。
即便是符合申请电子签证条件的学生也并非都适合做电签，例如资助人条件复杂，或者资金来源复杂，要解释资金状况所需要提供的资料繁多，这类申请人都不适合做电签。使馆电子签证要求上传的文件数量、大小都非常有限，若是资料过于复杂，则无法将所需文件都递交，这样签证官便无法了解申请人的全面情况，因此可能会对签证申请带来很大的困难。
另外，目前大多数学生都认为电子签证速度比较快，所以在想赶开课的前提下，递件时间都十分仓促。然而由于每个申请人的具体情况都不一样，如果递交电子签证距开课时间太短，有可能会导致学生赶不上开学。因此，在递交此类签证时，申请人一定要做好延期开学的准备。
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